Atlantis Rising 2e édition propose de nouvelles illustrations et des graphismes modernes, créés pour sublimer le thème fort du jeu. La phase d’Attaque des Athéniens a été remplacée par la phase de Colère des Dieux, nécessitant une planification plus stratégique et ajoutant un sentiment d’urgence.
Les pouvoirs du joueur incarnant le Conseiller ont été élargis et renforcés pour être plus impactants, et le deck de Connaissances a également été revu et étendu. Les éléments variables du portail, une fois construits, n'offrent plus des bonus à usage unique, mais créent de nouveaux points de placement d’ouvriers où les joueurs peuvent envoyer les citoyens Atlantéens pour mettre en place leurs actions et essayer de sauver leur île !